À titre d'info, je vous décris la solution qui est en place depuis 10 ans sur playdiplomacy.com (avec une problématique légèrement différente).
a) Les abandons sont comptabilisées comme des éliminations dans tous les cas (c'est rude, mais il y a eu, par exemple, le cas encore récent d'un type très bien classé sur le site concurrent, webdip, qui quittait ses parties dès qu'elles tournaient mal, et qui n'était justement jamais pénalisé par le système).
b) Les remplaçants dont la perf est positive voient leur résultat comptabilisés dans tous les cas.
c) Pour encourager les remplacements (et le ratio d'abandons est probablement crucial dans le choix de la méthode d'incitation), la perf négative d'un remplaçant est purement et simplement ignorée mais à une seule condition :
d) il faut que le remplaçant ait au préalable démarré ET terminé une partie pour pouvoir bénéficier de ce "bouclier". Le but ici est d'éviter que des petits malins abusent du système (du genre de ceux qui trustent le haut du classement gunboat sur Conspiracy parce qu'ils qui ne démarre jamais de parties et ne font que des remplacements, pour ne jamais perdre de points ). Le "bouclier" de playdip se désactive dès la partie terminée (quel que soit le résultat du remplaçant, positif ou négatif). Playdip cherchait donc à inciter à un ratio de grosso modo de 50% de parties démarrées pour 50% de remplacements par joueur.
e) le résultat négatif d'un remplaçant qui n'a pas de "bouclier actif" est comptabilisé normalement.
Votre problématique est probablement différente, avec un taux d'abandons sûrement plus faible, un recours aux retards/pénalités pour éviter les DC et avec la valorisation des tournois et ligues par rapport au seul classement ELO.
Mais je crois que les exemple des autres sites/communautés sont toujours bons à connaître.